【物語の始まり】
第三次冷戦…高速経済成長を遂げ、影響力を拡大させたロシアが親ロシア派の諸国と手を組み、アメリカを始めとするNATO陣営と対立するようになった。
両陣営の対立が激化する中、マキシマス・ヒルベルトによって世界最高峰の技術と開発力を持つ民間軍事会社NeoForceが設立される。その数年後、軍艦を模した装備を用いる特殊部隊、ネオフォース海軍艦隊を新たに創設した。
その後突如として現れた、各国の海軍を凌駕する力を持つ謎多き「深海艦」。
各国に残された唯一の対抗手段は、ネオフォース海軍艦隊に救援申請し、隊員に深海艦を撃退してもらうほかなかった……
正体不明の敵「深海艦」とは…?彼女たちが戦い続ける理由とは…?ネオフォース隊員として戦い続ける彼女たちの物語が今はじまる…