暑假期間,龍炎的興趣小組在亞古力原始叢林裏執行最後一次研究任務的時候突然天空中無數火球像流星雨一樣灑向叢林,龍炎他們只好先躲進一個山洞裏,就在山洞裏他們發現了先知留下的四部晶碼機,在瞭解晶碼機部分功能時,他們分別召喚出各自的晶碼獸並相互認識,這時,他們突然遇到了由於煞星軍團帶來的太空輻射所變異的花臉蝙蝠獸,在他們驚恐萬分時,他們的四個寶貝級晶碼獸一起出擊打敗了蝙蝠獸,晶碼機指引着他們走到了叢林密室,在那裏他們懵懂地瞭解到了自己的使命,那些帶有預言的壁畫告訴他們被選召來找到巨大的能量源——四塊水晶才能拯救地球,而煞星也在尋找這四塊水晶,這場戰爭的勝敗,就在於他們是否能得到這四塊水晶。並且有一幅尋找水晶的路線圖,孩子們用晶碼機將路線圖掃描下來。由於事情重大使得孩子們猶豫不決,就在這時黑蜘蛛獸出現了,青龍獸奮勇出擊,並且神奇的進化成為了初級晶碼獸——炎龍獸,打敗了黑蜘蛛獸。孩子們逐步明白了:必須發揮自己的智慧和力量去幫助各自的晶碼獸,讓它們得以一步一步的更加強大——即進化升級,才能打敗敵人,完成對他們來説似乎太過重大的任務。