劇情設定在架空的21世紀。日本海上自衛隊和中國海軍在尖閣諸島海域發生軍事衝突,日本政府為此出動航空母艦「伊吹」。
20XX年10月,疑似偽裝(後證實)為船難受難者的特工登上了尖閣諸島的南小島,並主張「本島為中國固有疆域,我們在等待中國船艦的救援」,此事件被稱為「尖閣諸島中國人上陸事件」。意圖進一步入侵日本領海的中國海警船與海上保安廳的巡邏艇發生衝突,並對前往調查的海上自衛隊護衛艦進行威嚇射擊,使得雙方緊張進一步升級。日本政府雖然為了避免無可挽回的情況發生而對中國採取了低姿態,暫時避免了局面進一步惡化,但深感芒刺在背的首相也決定加快「天馬計畫(ペガソス計畫)」的腳步,加速建設新型護衛艦,並以本艦為核心創設新的護衛隊群。 事件一年後,自衛隊實質上的第一艘航空母艦「伊吹(いぶき)」號竣工。首任艦長為前航空自衛隊王牌飛行員的秋津龍太一佐,並由新波歲也二佐任副艦長兼航海長。認同自衛隊專守防衛、人命第一的行動原則並以此為豪的新波副艦長,對於秋津艦長認為自衛官是軍人,不得已時使用武力甚至賭上性命也無妨的態度雖然抱有疑惑,但仍努力整合團隊,避免表現反意的在各地進行航海演習。