兩年前
神科陣與家人乘坐的飛行船在進行月球之旅的時候不慎墜毀，
神科陣雖然然奇跡般生還，但也失去了家人。從此之後
神科陣就飽受著來自世間的指責和好奇的目光，某日目擊到了連環殺人現場，並邂逅了一個自稱
托亞的少女，與
托亞命運的邂逅，
神科陣的命運齒輪轉動了起來…
近年的未來，地球上的人類的安危被來自冥王星的巨大隕石"塔納托斯"所威脅著。
為了對抗
"塔納托斯"，人類以國際太陽系開發機構「ISDA」為發足點，秘密進行着一向不為人知的開發計劃，這個計劃被命名為「D計劃」，這個計劃的內容為利用在小笠原近海發現的迷之生命體「龍」進行生態兵器的開發，然後利用「龍」去直接破壞
"塔納托斯"，正在這個計劃正在推進的同時，因事故在兩年前失去家人的孤獨少年與搭救他的迷之少女命運般的相遇了……
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