第一集
有點靈感應力的女孩春日琴子,她班上有個其貌不揚的少年護國寺黑郎。琴子跟蹤他,發現他竟然是個色到不行的少年!而且擔任名為「妖怪醫生」的謎樣工作。唔嗯…幫妖怪治病要做什麼呢?本書還收錄連載前的2個短篇。
第二集
「妖怪醫生」第2集同樣有許多個性豐富的妖怪包括:溼女、二口女、豆腐小僧、煙煙羅、貓又、百百目鬼、兒啼爺、座敷童子等等,妖怪醫生黑郎與護士琴子每回遇到不同的妖怪,幫他們解決各種疑難雜症。妖怪數目之多,可與「鬼太郎」相比!
第三集
「妖怪醫生」第3集中出現的妖怪包括:土轉、天邪鬼、雪女、龍、土蜘蛛等等,護國寺黑郎與春日琴子每回遇到不同的妖怪,幫忙解決各種疑難雜症,這次出現了專偷妖界寶物的獵人,連累兩人被土蜘蛛追殺…劇情緊湊明快,不容錯過。
第四集
「妖怪醫生」第4集中出現的妖怪包括:鬼子母神、以津真天、加牟波理入道(廁所的神)河童河太勝平、SATORI(覺)等等。護國寺黑郎等人依舊遇到不同的妖怪,幫忙解決各種疑難雜症。人與妖怪間的友情,令人感動。
第五集
「妖怪醫生」第5集中出現的妖怪有姑獲鳥,為了保護人類的孤兒們,不惜淪為陰陽師為惡的鷹犬;黑郎的監視者貓又?阿又,對黑郎和他的夥伴們下達特訓指令!修行內容是,黑郎與同伴學習五行,彼此展開戰鬥!
第六集
「妖怪醫生」第6集出現的妖怪有吸血鬼、迷途鬼、老天狗、鳳凰、犬神等等。護國寺黑郎在靈力修行的過程中,同伴春日琴子被妖怪擄走的同時,黑郎被少女外形的鬼襲擊!好不容易擊退沒多久,出現在眼前的是謎樣的敵人吸血鬼!不知為何,他也在找春日琴子…
第七集
因為「天神」吸血鬼甦醒的關係,讓妖怪與人類不知所措。這時候,妖怪醫生護國寺黑郎的同伴春日琴子被妖怪擄走,為了救琴子,黑郎一行人趕往妖界。面對漸漸逼近的天神與妖怪的大戰,形勢告急!黑郎等人遇到了妖界守衛烏天狗壬,溼女的妹妹乙姬;天邪鬼在危機之中大顯鬼威!
第八集
「妖怪醫生」第8集護國寺黑郎在旅途中遇到妖怪.網剪。網剪最重要的剪刀雖然受了重傷,但是卻一直拒絕接受治療。因為網剪與她的人類好友立下了一個約定。這個約定就是只要少女說出來,網剪就要用她的剪刀替少女結束性命…
第九集
睽違數百年,吸血鬼再度甦醒。妖怪與人類對這樣的劇烈變化感到不知所措。「妖怪醫生」護國寺決定與吸血鬼對決,保護夥伴琴子與芸芸眾生。吸血鬼突然攻擊保護琴子的醫療之神白澤!就在四面楚歌的局面,黑郎來了!