名偵探柯南：瞳孔中的暗殺者

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連續兩位東京警視聽的現任刑警慘遭殺害，而遇害的兩位刑事都手握警察手冊氣絕身亡！
警官連續殺人事件
這意味著甚麼？是對付警官的恐怖行為，或是過激派的暴行？警視聽正對此兇殺案件有關的人事物及警察組織內部著手進行搜查。而巨大組織的內部秘密卻如高牆般不可窺探！
江戶川柯南與小五郎前往警視聽向目暮警官、白鳥警官查詢有關殺人事件的情報，但是一直很友善的倆人卻以此事不可告知而拒絕了。在小五郎努力追問下，卻得到白鳥警官一句：『NEED NOT TO KNOW﹝不需要知道﹞......』這是警察間所用的密語，也就是殺人事件與警察內部組織有關！
小蘭也遭魔掌襲擊
小五郎、柯南和多名警官參加白鳥警官妹妹的婚宴，席間突然停電，小蘭和女警佐藤都在化妝室中，正當小蘭拿起身旁的手電筒時槍聲卻響起，佐藤警官為掩護小蘭而挨槍，聽到槍聲的小五郎等人湧入化妝室時犯人卻已不著痕跡地脫逃了，這時，小蘭卻因承受不了佐藤警官重傷昏迷的打擊，從此喪失了所有的記憶！
NEED NOT TO KNOW
一連串的殺人事件與隱藏在警察組織內部的秘密使得柯南開始著手調查兩者間線索的關係。為了保護小蘭的生命，以及喚回小蘭對工藤新一的記憶，柯南誓死也要將此精心策劃完全犯罪的兇手繩之以法！