數千萬年前,被稱作降臨者的外星人來到地球,為研發生體兵器而創造了人類,並從人類開發出負責戰鬥的獸化兵和一名負責統御的獸神將(阿卡菲爾)。「強殖裝甲·單元G」本來為降臨者的基本配備,一日降臨者使一名人類殖裝「強殖裝甲·單元」,殖裝後的人類發揮了遠超過降臨者殖裝後的能力、並且不受控制。由於降臨者發現人類有不安定的因子存在,因此要毀滅地球另覓他處。獸神將阿卡菲爾爲了阻止降臨者毀滅地球的計劃不惜反叛,以自己的力量將降臨者的巨大隕石擊毀,自己也因力量耗盡陷入長眠。轉眼間400年過去,阿卡菲爾甦醒過來,為了向降臨者復仇,以自己的獸神將水晶體分割,調製出其餘十一位獸神將(每人各有阿卡菲爾一部份的能力)並組建了背後控制全世界的秘密組織克諾斯,一直在秘密將人類調製成獸化兵。時至今日,在日本的魅神山中留下來的三套「強殖裝甲·單元」,一直是克諾斯求之不得的最高秘密。然而,組織裏面一小部分反對將人類調製成獸化兵的科學家,集合起來煽動擁有獸神將能力的獸神將試驗體叛變,終於成功將3個「強殖裝甲·單元G」奪取出去。克諾斯派出獸化兵追捕並尋找散落在外的單元。
一日,獸化兵正在追捕並準備回收被獸化兵實驗體偷出的「強殖裝甲·單元G」,戰鬥中發生爆炸把「強殖裝甲·單元G」散落在成澤山。一個平凡的中學生深町晶偶然拾到神秘組織克諾斯的超級生體兵器「強殖裝甲·單元」,因意外下啟動控制裝置而得到殖裝成Guyver的能力,成為第一位殖裝體Guyver I,並與圖謀征服世界的克諾斯展開激戰,後來遇上本為克諾斯日本支部長卷島玄藏養子的卷島顎人,發現其身份原來是以打倒克諾斯為目標的Guyver III,Guyver I和Guyver III聯合獸神將試驗體的村上征樹,一起為打倒克諾斯而戰鬥。