【史瑞克三世】的故事主要是要找尋誰將會成為“遠的要命王國”的王位繼承人，費歐娜公主的父親哈洛國王在駕崩之前，希望史瑞克可繼承王位管理“遠的要命王國”。但史瑞克自認不合適擔任國王，因此哈洛國王在臨死前告訴史瑞克可以去找亞遜王子來繼承，於是史瑞克就再度和他的最佳拍檔驢子和鞋貓劍客出發去尋找“遠的要命王國”的王位繼承人。
值得一提的是，這回除了要顛覆“圓桌武士”的童話故事外，所有童話故事裡最美麗的公主們也會在【史瑞克三世】裡相聚成為費歐娜公主的姐妹淘，包括白雪公主、灰姑娘、睡美人和長髮姑娘，他們將一同悍衛“遠的要命王國”，決不讓白馬王子伺機謀篡王位…。
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