故事背景
和第８帝國軍戰爭(前作)已經過了半年。有一天，位於遙遠的海洋另一邊，
帕魯迪亞大陸的索席耶堤博物館，透過其位於帕南姆城的分部提出了「希望能邀請該地最強的冒險家過來」這個要求。瑪格、莉妮亞、葛雷，和硬要跟來的青因４人受到請託，就這麼坐上了來往大陸間鐵道的列車，往帕魯迪亞大陸而去。途中受到了覬崳索席耶堤挖掘品的盜賊團「紅狼」及其頭目卡爾卡諾的襲擊，還好擊敗他之後平安地到達謬傑比魯。瑪格等人見過了索席耶堤首席白髮老頭之後，又受到他的請託，要去調查遺跡。展開新冒險的瑪格，在他們的身邊正漸漸地出現變化。瑪格及莉妮亞的面前，出現了幻影般的謎樣少年尤魯加。似乎知道莉妮亞真正身分的他究竟是什麼人？瑪格這場冒險目的地又是何處？一代中未解之謎，即將揭曉。
武器改造
改造武器是先史文明人為了支援自己日漸衰竭的肉體，所用的行動支援工具總稱。在現代則是被許多冒險家用來當做探索遺跡的道具。改造武器在戰鬥時能發揮強大威力，比一般的攻擊更能造成敵人嚴重受損。並且具有豐富的變化性，藉由交換零件可以發揮出不同的效果。EVOLUTION２中也增加了改造武器的種類，更能使用於戰鬥以外的目的！
戰鬥
在畫面右邊顯示攻擊次序的重要戰鬥系統這次仍然保留著。雖然用改造武器等輔助工具可以發揮強大威力的必殺技，但要換到下一步的行動前，會因為僵硬而花費較長的時間。考慮好敵人的行動次序再做行動的話，就不會留給敵人做行動的時間，而得到勝利了。另外，可以時常變換的戰鬥隊列也是非常重要的。隊列中也會含有敵方的怪獸，依其距離不同，相互受到影響而受損的情況也會有所變化。必殺技也是一樣，隊列的不同，效果也大有不同。尤其是對於複數敵人有效的必殺技，有其效果範圍的限定，必需要注意。
圖片影片
