對於《
菇菇栽培》的遊戲流程相信大家都十分熟悉（即使沒玩過也非常容易上手），因此這次的重心將會放在新系統的部分，而遊玩方式就不在此贅述了，簡而言之就是投入營養劑、放置、收穫這樣的流程囉。
進入遊戲時，最先看到的變化之處就是栽培用的原木從一根變成兩根了！如此一來栽培的效率也提升一倍。
跟前作相比，由於本作在系統上改變的幅度較大，為避免玩家不知從何著手，這次新增了「任務（Order）」系統來指引玩家。也因此，以往解鎖配件的條件也從「栽培出指定菇菇」變成「完成指定任務」了。
在前作中，玩家可以使用 Np 點數來升級照明燈、暖爐、灑水器這幾個配件，以提升整體的配件等級，並栽培出更稀有的菇菇。但是在本作中，若想升級配件，除了 Np 點數外還需要消耗特定的材料，而獲得材料的方式，就要依靠本作新登場的配件－「收穫箱」啦！
本作在 Np 點數上方新增了一個「收穫計量表」，玩家收穫的菇菇除了轉化為 Np 外，同時也會提昇收穫計量表，而當計量表提升至特定數值時，便可獲得對應的材料。每一種收穫箱的差異，在於滿足計量表時所能獲得的道具內容均不相同，也因此，若是用錯箱子，可是一輩子都拿不到想要的材料喔！
除了既有的場景配件外，本作還新增了一組全新的「養分供應機（Food Machine）」，其中包含了機器主體、研磨器、抽取器、均質機四個部分以及「栽培計畫」。其中，主體的部分目前只有兩種，除了外觀差異之外似乎沒有特殊的功能；升級研磨器則能夠略微提升稀有菇菇的出現率；均質機則可以減緩菇菇枯萎成「乾枯菇菇」；抽取器則具有普遍提升稀有菇菇出現率、生長速度、以及防止枯萎的效果。
在這之中較為特殊的大概就是栽培計畫了。不同的栽培計畫會影響各種類型菇菇的出現機率，像是使用「紅色計畫」時就有較高的機率栽培出帶有紅色屬性的菇菇品種；而使用「英雄計畫」則能夠吸引想成為英雄的菇菇出現！
延續前作「季節」的概念，本作則改以「主題」的形式來呈現，但與季節不同之處，在於主題並不會影響栽培出的菇菇種類（至少筆者目前看不出顯著影響…），而是改變既有菇菇的外觀，像是在「悠閒草原」主題中，菇菇們會拿著飯糰、三明治，一副要去遠足的模樣；而在英雄主題中，則會以特攝英雄的扮相出現。最有趣的是，在更換主題時連 BGM 也會跟著變化。這個系統看似沒有甚麼實質功能，但是卻極富樂趣，若想體驗這個系統的樂趣所在，不妨隨時依照心情來改變主題看看吧！
而在這一次的菇菇圖鑑中，也針對每個菇菇的角色特性做了更細緻的刻畫，像是個性、弱點、專長、心願等等，會隨著收穫數的增加而解鎖，維持系列作一貫的詼諧風格，其中也不乏令人會心一笑的設定，像是長高菇菇的心願是擁有一雙修長的腿、而雙胞胎菇菇則希望能做分離手術。
圖片影片
《觸摸偵探 NEO 菇菇栽培研究室》即日改版追加新主題與 32 種菇菇
【心得】總時間小技巧
